El Centro Médico “San Rafael” S.A. fue fundado inicialmente con el nombre de “Sanatorio San Rafael” en el mes de febrero de 1980 sobre la 9na Avenida entre Segunda y Cuarta calle de la zona 1, Huehuetenango, su fundador, el Dr. Jorge Pérez Ixchop, eligió ese nombre por ser el Patrono de los enfermos y curaciones en la mayoría de las religiones.